Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms