Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms