Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Epha1Q60750 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms