Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms