Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ItgaeQ60677 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms