Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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PtprnQ60673 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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PtprnQ60673 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
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PtprnQ60673 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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PtprnQ60673 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PtprnQ60673 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
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PtprnQ60673 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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PtprnQ60673 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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PtprnQ60673 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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PtprnQ60673 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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PtprnQ60673 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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PtprnQ60673 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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PtprnQ60673 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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