Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClpbQ60649 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms