Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp13a3Q5XF89 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp13a3Q5XF89 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp13a3Q5XF89 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp13a3Q5XF89 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp13a3Q5XF89 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms