Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psme4Q5SSW2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Psme4Q5SSW2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psme4Q5SSW2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psme4Q5SSW2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psme4Q5SSW2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psme4Q5SSW2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Psme4Q5SSW2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psme4Q5SSW2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psme4Q5SSW2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Psme4Q5SSW2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms