Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms