Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zzef1Q5SSH7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zzef1Q5SSH7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms