Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf215Q5SPX3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf215Q5SPX3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf215Q5SPX3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms