Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms