Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms