Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms