Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL18

Tmem171, Transmembrane protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem171Q4KL18 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms