Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brinp3Q499E0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms