Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms