Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms