Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.3■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.29■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.29■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.29■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.27■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933416C03RikQ3V063 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms