Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
E330034G19RikQ3UWX6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
E330034G19RikQ3UWX6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
E330034G19RikQ3UWX6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E330034G19RikQ3UWX6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E330034G19RikQ3UWX6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E330034G19RikQ3UWX6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E330034G19RikQ3UWX6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E330034G19RikQ3UWX6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E330034G19RikQ3UWX6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E330034G19RikQ3UWX6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E330034G19RikQ3UWX6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E330034G19RikQ3UWX6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E330034G19RikQ3UWX6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E330034G19RikQ3UWX6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E330034G19RikQ3UWX6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E330034G19RikQ3UWX6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E330034G19RikQ3UWX6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E330034G19RikQ3UWX6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E330034G19RikQ3UWX6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E330034G19RikQ3UWX6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E330034G19RikQ3UWX6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
E330034G19RikQ3UWX6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms