Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms