Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfn4Q3UV66 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms