Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gm5460Q3UQ97 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gm5460Q3UQ97 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gm5460Q3UQ97 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gm5460Q3UQ97 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm5460Q3UQ97 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm5460Q3UQ97 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm5460Q3UQ97 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gm5460Q3UQ97 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gm5460Q3UQ97 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gm5460Q3UQ97 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gm5460Q3UQ97 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5460Q3UQ97 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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