Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms