Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJC8

Uncharacterized protein C5orf34 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJC8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UJC8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UJC8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UJC8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UJC8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UJC8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UJC8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3UJC8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UJC8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UJC8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UJC8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UJC8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UJC8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UJC8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UJC8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3UJC8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.4 ms