Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lmod2Q3UHZ5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms