Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mier3Q3UHF3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mier3Q3UHF3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Mier3Q3UHF3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mier3Q3UHF3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Mier3Q3UHF3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mier3Q3UHF3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mier3Q3UHF3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mier3Q3UHF3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mier3Q3UHF3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mier3Q3UHF3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mier3Q3UHF3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mier3Q3UHF3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mier3Q3UHF3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mier3Q3UHF3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mier3Q3UHF3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mier3Q3UHF3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mier3Q3UHF3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.8 ms