Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms