Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms