Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Fam35aQ3UEN2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Fam35aQ3UEN2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam35aQ3UEN2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam35aQ3UEN2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms