Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms