Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LbrQ3U9G9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LbrQ3U9G9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms