Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms