Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

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Length 584 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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Fam117bQ3U3E2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Fam117bQ3U3E2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Fam117bQ3U3E2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Fam117bQ3U3E2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Fam117bQ3U3E2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Fam117bQ3U3E2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Fam117bQ3U3E2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Fam117bQ3U3E2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Fam117bQ3U3E2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Fam117bQ3U3E2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Fam117bQ3U3E2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam117bQ3U3E2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Fam117bQ3U3E2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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