Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U1D9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U1D9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U1D9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms