Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms