Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hace1Q3U0D9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms