Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms