Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc28Q3TX51 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms