Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3TTJ4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q3TTJ4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q3TTJ4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTJ4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms