Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fndc4Q3TR08 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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