Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Ctdnep1Q3TP92 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctdnep1Q3TP92 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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