Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLS3

Gdpgp1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpgp1Q3TLS3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdpgp1Q3TLS3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms