Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms