Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc13Q3TIR1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms