Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.5 ms