Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RubcnlQ3TD16 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RubcnlQ3TD16 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RubcnlQ3TD16 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RubcnlQ3TD16 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RubcnlQ3TD16 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms