Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prr27Q3SYJ2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms