Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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H2-M3Q31093 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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H2-M3Q31093 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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H2-M3Q31093 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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H2-M3Q31093 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms